Поддержка Java предложена первым 10 тыс. подписчиков с целью получения отзывов от сообщества Java-разработчиков. По уверению Google, поддержка основана на стандартах, поскольку App Engine использует стандартные Java API и библиотеки — разработчики могут работать с привычными Java-инструментами и фреймворками. Гарантируется несложное развертывание кода Java во все стандартные контейнеры J2EE-сервлетов.