Крупнейший в мире институт геномики BGI расположенный в китайском городе Шеньжень, запускает сервис, который позволит исследователям со всего мира выполнять доступный биоинформационный анализ секвенирования ДНК в облаках.
Новый сервис EasyGenomics объединяет интуитивный интерфейс и автоматизированный конвейерный анализ, программное обеспечение и инструменты компании BGI. Они интегрированы в крупнейшую в индустрии платформу секвенирования и предоставляют все, что может понадобиться биологам, врачам и ученым, занимающимся информатикой для автоматизированного анализа последовательности данных ДНК.
Ограниченную бесплатную бета-версию нового сервиса BGI представит для биологов и специалистов по биоинформатике на конференции Bio-IT World 2012.
Делая доступнее возможности в геномике широкому кругу исследователей, EasyGenomics нацелен на приближение эры персонализированной медицины. «Мы надеемся упростить применение геномики в практике для клинической диагностики и комплексного анализа заболеваний,» – отметил доктор Лин Фэнг, вице-президент BGI. GPU-ускорение сокращает время проведения анализа последовательностей ДНК с пяти дней до пяти часов.
Облачный сервис EasyGenomics основан на гибридных вычислительных машинах на базе nVidia Tesla M2070 и M2075, которые ускоряют анализ последовательностей ДНК в паре с центральными процессорами. BGI планирует модернизировать сервис EasyGenomics за счет сотен дополнительных процессоров nVidia Tesla после полной установки системы, когда к ней получат доступ тысячи пользователей.
«Этот год может стать годом генома за 1 тыс. долл. благодаря быстрому сокращению затрат на секвенирование. Мы скоро утонем в потоке данных от генераторов последовательности генома», - полагает Самит Гупта, старший директор направления Tesla в nVidia.
BGI работает над секвенированием геномов разных форм жизни - от растений и микроорганизмов до гигантских панд, чтобы создавать лучшие лекарства, совершенствовать здравоохранение и разрабатывать генетически улучшенную пищу.