IBM сейчас предоставляет заказчику выбор, устанавливать ли Linux на его сервер, но, по некоторым данным, в ближайшем будущем все серверы Netfinity будут поставляться с предустановленной операционной системой SuSE Linux 7.0.
Важной особенностью этой ОС в отличие от ряда других вариантов Linux, является наличие виртуальной PC-машины, позволяющей под Linux запускать Windows-приложения. Выбор SuSE Linux таит в себе по крайней мере два сюрприза. Во-первых, впервые IBM будет в обязательном порядке предустанавливать на свои компьютеры ОС производства неамериканской (в данном случае - германской) фирмы. Во-вторых, готовящаяся к выпуску 64-разрядная версия SuSE Linux ориентируется на вариант архитектуры процессора, предложенный AMD. Это может привести в недалеком будущем к ориентации IBM на процессоры AMD.