По прогнозу аналитиков Front Line, к 2006 году объем мирового рынка биоинформатики достигнет 1,7 млрд. долл. Соответствующие приложения, считают аналитики, способны снизить стоимость разработки лекарств на 33% и значительно ускорить процесс.
Рынок состоит из следующих сегментов: содержание, аналитическое ПО и поставка ИТ-инфраструктуры; комплексный годичный прирост рынка составит 20%, быстрее всего будет расти сегмент ПО. Стимулировать рост будет потребность в высокомощных системах добычи данных и в средствах комплексного анализа, в частности в системах моделирования взаимоотношений. Большая часть средств, выделяемых на биоинформатику, тратится на содержание (генетическую информацию для расшифровки последовательностей ДНК и т.д.). Ведущие поставщики - компании Celera и Incyte. Из приложений наибольшие затраты приходятся на системы для геномики; самый быстрый рост предстоит сегментам приложений для протеомики и фармакогеномики. К числу сдерживающих факторов относятся нехватка стандартов форматов данных, общих протоколов и технологий обеспечения интероперабельности. С расширением применения биоинформатики конечные пользователи станут отдавать предпочтение решениям, которые позволяют с минимальным расходом ресурсов упростить интерпретацию поступающих из разных источников данных, а также обмен ими и отслеживание изменений.