На новом посту он будет курировать финансово-экономический блок: финансовое обеспечение разработки, модернизации и эксплуатации информационных систем, в том числе за счет внебюджетных источников, и направление, связанное с размещением госзаказа. На нового заместителя министра столичного правительства возложены обязанности по контролю эффективности исполнения госпрограммы «Информационный город», экспертизе проектов в области городской информатизации и планированию развития новых технологий на присоединенных территориях. Он также сохранит за собой функции куратора программы модернизации столичного здравоохранения в части внедрения информационных систем.
В 1996 году Макаров основал «Консалт Бизнес Групп», специализирующуюся на консалтинге в сфере технического регулирования обращения медицинской техники, изделий медицинского назначения и фармацевтической продукции. В конце 2006 года был приглашен на должность советника директора Федерального фонда обязательного медицинского страхования, а с января 2007 года в должности заместителя директора ФФОМС курировал вопросы, связанные с лекарственным обеспечением и информатизацией системы обязательного медицинского страхования. Руководил разработкой концепции информатизации обязательного медицинского страхования, внедрением системы информационной безопасности, созданием экспертно-аналитической системы льготного лекарственного обеспечения и запуском Центра обработки данных, обеспечивающего работу фонда. После ухода из ФФОМС вернулся в бизнес. В 2011 году был назначен советником главы департамента информационных технологий города Москвы и руководил созданием и внедрением единой медицинской информационно-аналитической системы ЕМИАС. Под его управлением был запущен сервис дистанционной записи к врачу, началась масштабная поставка компьютерной техники для автоматизации работы врачей.