Среди особенностей ChemDraw Ultra 6.0 -- распознавание и отображение стереохимических структур, структурно-спектральные корреляции в ChemNMR, контекстное меню, а также интерактивная проверка структуры. Интеграция ChemFinder с Microsoft Excel упростила использование электронных таблиц в процессе поиска и наблюдения химических структур; кроме того, ChemFinder распознает и классифицирует структурные ссылки в Microsoft Word. Приложение CombiChem выбирает данные из баз данных ChemFinder и генерирует библиотеки, используя специализированные реакции. CombiChem выводит на экран структуры в электронные таблицы Excel, служащие для выявления кандидатов, генерирует файлы для синтезаторов и рисует плоские схемы. Дополнения ChemDraw и Chem3D интегрируют персональное рабочее место химика в сеть. Подготовленные соответствующим образом документы вызывают дополнения и позволяют просматривать химические структуры при помощи браузера, при необходимости экспортируя их для использования с другими приложениями.