Они отмечают, что в попытке получить преимущества от внедрения виртуализации пользователи обращают мало внимание на ее недостатки. Несмотря, что достоинств у этой технологии гораздо больше, чем недостатков, о последних не стоит забывать. Особенно это касается сложности управления и обеспечения безопасности. С расширением использования виртуализации (особенно в применении к "облачным вычислениям") риски могут стать более серьезными. Управление виртуальной средой остается непростой задачей, несмотря на совершенствование программных средств. Лишь немногие инструменты виртуализации интегрируются с ПО управления уровня ЦОД, таким как IBM Tivoli. Кроме того, на сегодня технология гипервизоров виртуализации открывает широкие возможности для различных угроз безопасности. Вендорам предстоит также решить некоторые проблемы лицензирования ПО виртуализации.